Service de criblage antiviral

Criblages de petites molécules et anticorps neutralisants

Responsable: Nathalie Gros (nathalie.gros[at]cemipai.cnrs.fr)

Le service de criblage du CEMIPAI rĂ©alise des tests de recherche de molĂ©cules antivirales Ă  façon.  Nos systèmes de criblage sont rĂ©alisĂ©s en plaques de culture, sur des modèles d’infections cellulaires in vitro. Selon le nombre de composĂ©s et la nature du test, les criblages sont rĂ©alisĂ©s manuellement ou semi-automatiquement au moyen d’une chaĂ®ne robotisĂ©e.

Le mode de fonctionnement de la plateforme nous permet de proposer diffĂ©rents types de prestations :

  • Une prestation de service complète rĂ©alisĂ©e par les ingĂ©nieurs du CEMIPAI, pour laboratoires acadĂ©miques ou privĂ©s
  • L’accès Ă  certains Ă©quipements (ex : PSM, cytomètre, lecteur de microplaques, microscopes)
  • Le dĂ©veloppement de projets scientifiques collaboratifs
  • La mise en place de partenariats avec l’industrie

Systèmes viraux disponibles proposés par le service criblage

SARS CORONAVIRUS 2 (SARS-CoV-2)

Production: Amplification sur cellules VERO E6, titration et stockage, deux souches disponibles: SARS-CoV-2 Institut Pasteur et SARS-CoV-2 (CHU de Montpellier)

Tests d’infection (plage de lyse) (merci à O.Moncorgé et C. Goujon @IRIM Montpellier)

Tests de sero-neutralisation pour anticorps neutralisants anti-SARS-CoV-2

Tests de criblage de molécules en CPE / MTS et RT-qPCR (molécule de référence : Remdesivir) sur cellules VERO E6, cellules pulmonaires alvéolaires humaines A549 exprimant le récepteur ACE2 (A549-hACE2), cellules pulmonaires épithéliales Calu-3, modèles Epithelix

VIRUS DE L’IMMUNODEFICIENCE HUMAINE (VIH)

Production, amplification virus WT et virus fluorescents

Tests de criblages de molécules sur lymphocytes primaires (PBL) par quantification de CAp24

VIRUS CHIKUNGUNYA

Production, amplification virus WT et virus avec rapporteur d’infection par fluorescence (mcherry)

Tests de criblage sur cellules VERO avec virus WT ou par fluorescence

VIRUS ZIKA 

Production, amplification virus WT et virus avec rapporteur d’infection par fluorescence (mcherry et NanoLuciferase)

Tests de criblage sur cellules VERO avec virus WT ou par fluorescence NanoLuciferase

VIRUS DE LA DENGUE

Production, amplification virus WT

VIRUS DE LA FIEVRE DE WEST NILE 

Production, amplification virus WT

EXPERTISES ET SERVICES 

  • Criblage cellulaire : cellules infectĂ©es par des virus sauvages, isolats cliniques ou virus modifiĂ©s avec rapporteur fluorescent, tests de rĂ©sistance…
  • Criblage en plaques 96 puits, manuel ou semi-automatisĂ©
  • Read-outs : plages de lyse, plaque assay / CPE, viabilitĂ© cellulaire, RT-qPCR, absorbance, fluorescence, luminescence
  • ExpĂ©rimentation animale sur embryon de poisson zèbre
  • Imagerie automatisĂ©e (Zeiss Celldiscoverer 7 avec Confocal LSM900)

COMPOSES

Le CEMIPAI a accès à la grande collection de petites molécules de la chimiotèque du CNRS. Nous sommes également en relation avec l’institut de chimie Pôle Balard de Montpellier, expert en conception, synthèse et pharmacologie de biomolécules pour le traitement des pathologies humaines et animales. Toutes les autres bibliothèques de composés peuvent être testées.

DE LA CELLULE AU PETIT ANIMAL

Nous dĂ©veloppons des modèles d’infection pathogènes / hĂ´tes in vivo. Nous travaillons en partenariat avec les animaleries BSL3 de l’UniversitĂ© de Montpellier et avec AZELEAD, une sociĂ©tĂ© spĂ©cialisĂ©e dans l’imagerie de l’embryon de poisson zèbre (zebrafish). Le criblage est rĂ©alisĂ© par microscopie photonique automatisĂ©e.  

N’hĂ©sitez pas Ă  nous contacter pour plus d’information 

SARS-Cov-2

Amplification, titration et stockage

Mise en place de tests d’infection (plage de lyse)

 Test de sero-neutralisation pour anticorps anti-SARS-CoV-2

         

PROJET IRMB CEMIPAI ANR CoViNK (Martin Villalba)

Criblages petites molécules anti-SARS-CoV-2

          

 

 

 

 

EquipEment

 

  • Un robot de pipettage multicanaux Zephyr multichannel liquid handler  permet de prĂ©parer, rĂ©pliquer ou reformatter ou diluer en sĂ©rie des plaques de cultures de 96-et 384-puits
  • Un système de lavage de plaques Biotek
  • Un lecteur de microplaques Envision Multilabel reader (Perkin Elmer). Cet spectrophotomètre/fluorimètre multifonctions permet la lecture de signaux de fluorescence, luminescence ou absorbance. 
  • Un bras passeur Twister II Microplate Handler permet de distribuer les microplaques entre les divers Ă©lĂ©ments de la chaĂ®ne.
  • Un hĂ´tel incubateur de microplaques LiCONiC STX44(2 racks pour une capacitĂ© totale de 44 plaques)

La station est pilotée par iLinkPro, un software de contrôle robuste et simple permettant de connecter tous les éléments de la chaîne.